项目主持人：蓝柯　 中科院上海巴斯德研究所

　　项目简介
　　项目编号：2009ZX10004-105
　　项目依托部门：中国科学院上海生命科学研究院 科技部
　　执行年限：2009-01至2010-12

　　传染病威胁人类的健康和国家安全日益严重。近30多年来发现了40多种新病原，其中大多数是新病毒。目前，传染病已成为全球发病率最高的疾病，是造成全球每年5000多万人死亡的第二大原因，严重危害人民的健康和生命，极大地阻碍、破坏经济和社会的发展。在传染性疾病爆发时，只有迅速、准确地确定病原体，才能实施有效的处置措施，从而在控制传染病的过程中赢得时机。
　  发展并建立用于传染性疾病病原体排查的高通量技术平台将有利于传染性疾病的防控。发展这样一种技术平台，需要集成病毒学、基因组学、生物信息学以及免疫学等不同领域的专业技术。本课题旨在联合在上述领域具有领先水平的科技人员进行攻关，以期建成用于呼吸道感染及中枢神经系统感染病毒病原体排查的技术平台，实现有限目标的突破，并为后续的技术平台的扩展奠定重要基础。

　　合作单位:
　　上海疾病预防控制中心
　　北京地坛医院
　　上海第二军医大学
　　浙江大学
　　军事医学科学研究院
　　上海生物信息技术研究中心
　　上海人类基因组研究中心

　　研究进展:
　　上海巴斯德所开发了“甲型H1N1流感快速检测分型试剂盒-多重荧光RT-PCR方法”，用于甲型流感病毒检测和HA基因分型。已发表在国际学术期刊J Clin Microbiol上。该技术结合便携式实时PCR仪Smartcycler II，可适用于实验室和野外实地研究。经检测，该方法所有引物和探针与其他常见的副流感，冠状病毒，呼吸道合胞病毒，B型和C型流感，偏肺病毒，博卡病毒，腺病毒无交叉反应，且各流感病毒亚型之间无交叉反应。该方法与目前采用的方法相比，最大的特点为多重PCR,其优势是能同时检测多种流感亚型，从而达到诊断与鉴别诊断的目的。同时，该方法能在三小时内获得检测结果，从而达到快速诊断的要求。该技术已在香港巴斯德所对临床样品进行过测试，取得了理想的结果，已推荐给亚太地区巴斯德网络和上海市疾病预防控制中心。