儿童是病毒性脑炎的主要攻击目标，包括日本脑炎和肠道病毒性脑炎。然而，大部分脑炎发病原因尚不清楚。日本脑炎通常会使受感染者急性发热，可能会在成人和儿童身上引起神经性症状，每年报告病例为3万-5万。
　  上海巴斯德所新生病毒研究组和病毒性免疫信号传导研究组联合进行脑炎致病机理研究，致力于第二代疫苗的研究。在分子诊断方面，上海巴斯德研究所已开发出相关技术，对脑炎中的致病病毒进行鉴别，并用于监测西尼罗病毒的可能侵入和传播。