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  *2017年,云南-大湄公河次流域地区病原发现与疫情预测的“金矿计划”(Gold Mine Project):项目拟在云南-大湄公河次流域地区,尤其是我国境内,针对区域性高发流行病(疟疾、登革热),监控病原耐药谱和耐药病原传播规律,组合和发展多元化研究工具和手段(包括检测,治疗,生物预防和疫苗等),形成区域性疟疾、登革防治的科技示范基地。针对该区域富含的潜在未知病原,开展综合分子流行病学、病原组学的病原发现研究,获知GMS区域虫媒病原谱和传播规律,建立下一个大流行的预测模型。开展多国间、多机构间科技协作,科技人员互访与培训的长效机制,加强该地区疫情防控的科技力量,为中国-中南半岛经济走廊安全稳定提供科技支撑。 

  *2016年,“中非彩虹计划”(Asian-African Rainbow Initiative):该计划以上海巴斯德所为领导,牵引中科院武汉病毒所和昆明动物所、云南卫计委等国内机构,联合巴斯德网络分布在柬埔寨、老挝、越南、塞内加尔、几内亚比绍、中非共和国、法国、意大利等国的研究所,比利时、西班牙、澳大利亚等协作机构和大学,数十个国家、上百个实验室、上千名科研人员,共同就传染病疫情预测与疾病防治解决方案开展全方位长期合作。该计划拟在东南亚和非洲建成4-6个有地域和传染病谱式代表性的科研基地,1个产学研教医集成示范基地。通过这种洲际科技合作,获得一批针对亚非国家地区,尤其是我国境内的已知、未知病原的监测与诊断技术与产品,一批重大疫病(包括耐药性病原)的治疗与预防的技术与产品,一系列针对区域性流行病、全球性疫情控制和危害去除的策略与手段。该计划的实施,将有力推动我国牵头的重大国际合作项目的落实,并为“健康之一带一路”战略的实施提供社会与公共安全保障。 

  *2015,美国国家卫生研究院立项的RO1国际项目“潜伏态核抗原在卡波氏肉瘤病毒致病过程中的功能研究”(Versatile functions of LANA in KSHV pathogenesis)和“恶性疟原虫var基因的调控机制”(var gene regulation mechanisms in Malaria parasite Plasmodium falciparum),资助经费分别为52万美元和65万美元; 

  *2012年,引进海内外多位顶尖人才组建了“丙肝疫苗研发的免疫学研究团队”并获得“中科院-国家外专局创新团队国际合作伙伴计划”资助。团队核心成员为免疫学、病毒学和疫苗学领域的知名科学家,分别供职于国内外知名大学或研究、医疗机构,如耶鲁大学、贝勒医学院。该团队将为丙型肝炎病毒的疫苗设计和佐剂开发研究提供新的策略,努力为研制安全有效的HCV疫苗、减轻丙肝这一全球性公共卫生负担做出积极的贡献。 

  *20127月,重症EV71感染在柬埔寨流行并导致该国约70名儿童死亡。应柬埔寨巴斯德研究所的邀请,在中科院支持下,上海巴斯德研究所派专家组赶赴柬埔寨开展科研合作。通过与柬埔寨巴斯德所、香港新发传染病国家重点实验室的密切合作,成功对在柬埔寨传播的EV71进行鉴定,为临床诊治提供了理论依据,减少了公众的恐慌,显示了上海巴斯德所对公共卫生突发事件的快速反应能力、应对能力和国际合作能力。中国卫生部陈竺部长专门发来感谢信,表彰上海巴斯德所的工作和贡献。2012年,上海巴斯德研究所与柬埔寨巴斯德研究所及越南巴斯德研究所签署研究合作协议,开展相关地区的EV71研究。 

  *2010年,与澳大利亚格里菲斯大学glycomics研究所 (Griffith University’s Institute for Glycomics)签署合作协议,联合开展抗感染和抗病毒基础研究以及药物研发前期研究。 

  *2010年,与英国利物浦热带医学研究院签署合作协议,共同致力于新药筛选的研究。 

  *20099月,研究所入选科技部和国家外专局首批“国家级国际联合研究中心”。 

  *2008514日,上海巴斯德研究所与道达尔集团在上海签署了一项为期三年的科学合作项目合同“中国传染病领域合作协议”,资助总经费为49.8万欧元。双方的合作主要涵盖三个战略性领域,包括:病毒性肝炎的基础、应用研究,病毒性肝炎培训,以及面向公众的病毒性肝炎预防知识宣传活动。 

  *20081125日,上海巴斯德研究所与国际著名阿海珐集团所属阿海珐基金会在巴黎续签合作协议“环境与新生疾病合作协议”,为期三年,资助总经费为45万欧元。根据新的协议,阿海珐将继续资助研究所在抗击新生传染病领域开展高水平科研培训、资助中国青年科研人员、艾滋病预防和治疗策略的研发、向公众宣传传染病预防知识。 

  *2007年,科技部国际科技合作重点科研机构项目“中国禽流感病毒株RNA聚合酶和NS1抑制IFN产生的致病机制研究”获500万元经费资助,研究所因此成为科技部国际科技合作重点科研机构(试点)。 

  *2006年,上海巴斯德研究所获得了两项欧盟第6框架项目。分别是环境宿主和系统中流感病毒抗性研究(与法国巴斯德所,武汉病毒所合作)和哺乳动物流感病毒感染的呼吸道固有免疫研究(与德国、比利时、英国、意大利、法国等机构合作)执行期为三年,总经费为33.23万欧元。 

  *2005年,“呼吸性疾病的实验病理学研究”项目:该计划是一项由法国巴斯德所牵头,中科院上海巴斯德研究所和亚太地区其他7个巴斯德研究所(分别位于柬埔寨,越南,新几内亚,日本和韩国等地)参加的、历时3年左右的国际合作项目。该计划部分经费由李嘉诚基金会赞助,今年资助上海巴斯德所金额约250万人民币,主要针对病毒性呼吸道感染疾病,进行流行病学和分子病毒学的研究,致力于快速诊断技术开发,病毒致病机理确定和疫苗开发。该项目中与研究所合作的单位还有美国哥伦比亚大学、国内的瑞金医院和汕头大学等。面对高致病性禽流感疫情的严峻形势,研究所加强了在病理学和快速诊断技术开发方面的研究,将快速检测系统和基于HA蛋白的禽流感新型重组疫苗的研究作为近期研究工作的重点。  

  *2005年,“黄热病病毒发病原理的分子机制研究计划(日本脑炎的生态学研究和传播性研究)”项目:研究所与法国巴斯德DEPRES实验室合作,通过确定病毒侵入寄主细胞和复制过程中突变基因的作用,研究减毒分子标志。这些研究将有利于根据分子标准,检验现行疫苗,并且有利于使用减毒病毒作为异种病毒抗原传送的载体,以及确定新治疗方法。项目将由法国AREVA公司赞助。 

  *2005年,“卫星监测迁徙鸟类携带病毒”项目:由中法两国科学家联合发起的关于监控鸟类迁徙以及鸟类传播疾病的生态学因素的研究项目。开展病毒及其在动物之间传播的、涉及多领域交叉的研究工作。法方合作单位以法国国家空间研究中心和巴斯德研究所为主。目前该项目研究的主要病毒锁定在禽流感、日本脑炎和出血热。 

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